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Necdin基因(NDN) 的母系對偶基因具有基因印痕(gene imprinting),只有父系的對偶基因能夠被轉錄成mRNA。
雖然Necdin被認為對於神經細胞的分化和成熟 ...
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題名: 神經細胞分化時Necdin基因甲基化調控之研究
其他題名: DNAMethylationStatusofNecdinGeneduringNeuronalDifferentiation
作者: 蔡宗樺Tsai,Chung-hua
貢獻者: 生命科學系碩博士班曾淑芬Tzeng,Shun-Fen
日期: 2010-03-18
上傳時間: 2011-02-1415:25:06(UTC+8)
摘要: Necdin由325個胺基酸所構成,為一與神經細胞分化有關的蛋白質。
其主要表現在神經細胞或骨骼肌細胞等後分裂時期細胞(postmitoticcells)。
Necdin基因(NDN)的母系對偶基因具有基因印痕(geneimprinting),只有父系的對偶基因能夠被轉錄成mRNA。
雖然Necdin被認為對於神經細胞的分化和成熟扮演著重要的角色,但是NDN本身是如何被調控的,目前還不是非常了解。
NDN位於人類染色體15q11-q13,此段基因如發生缺失(deletion),會造成稱做小胖威利症(Prader-WillisyndromePWS)的神經發育不正常遺傳疾病,此疾病也是一典型的與基因印痕有關的疾病。
基因印痕是藉由甲基化基因上CpG雙核苷酸上的胞嘧啶,使得基因表現被抑制的機制(genesilencing)。
亞硫酸鹽轉換(bisulfiteconversion)是一種能夠讓胞嘧啶(C)轉換成尿嘧啶(U)的方法,然而被甲基的胞嘧啶不會進行轉換,因此可以區分該胞嘧啶是否被甲基化。
利用這個方法,我分析了老鼠ndnCpG-rich區域的甲基化狀態。
DNA樣品取自E145、ndn突變老鼠大腦皮層的神經幹細胞,其ndn父系對偶基因插入了neomycin耐受基因(neomycin-resistantgenecassette),因此定序時可以利用Necdin和neomycin專一的引子區別父系和母系對偶基因。
我分析了23個介於-299到+93(ATG轉譯起點為+1)的CpG位置(CpGsite),而這23個CpG位置位於-264到+470的CpG島(CpGisland)。
同時,這23個CpG位置包含了轉錄和轉譯起點。
我預期大部分母系ndn對偶基因的CpG位置會被甲基化。
然而,定序結果顯示其未分化與已分化的大腦皮層神經幹細胞,CpG位置甲基化程度分別約為60%和53%。
父系ndn對偶基因方面,未分化與已分化的甲基化程度分別為62%與40%。
這顯示了不論是父系或是母系ndn對偶基因,在神經細胞分化時都會受到甲基化機制的調控,而且父系對偶基因受到的影響比母系還大。
此外,有些CpG位置在神經細胞分化時,其甲基化程度變動很大。
這些結果顯示在神經分化時,ndn的表現可能與某些特定的CpG位置甲基化有關。
NECDINisaneuraldifferentiation-associatedproteincomposedof325aminoacidsNECDINispredominantlyexpressedinpostmitoticcellssuchasneuronandskeletalmuscleTheNECDINgene(NDN)ismaternallyimprintedandonlythepaternalalleleistranscribedintomRNAAlthoughNECDINisthoughttoplayanimportantroleinneuronaldifferentiationandmaturationtheregulatorymechanismofNDNexpressionisnotwellunderstoodNDNislocatedinhumanchromosome15q11-q13whosedeletioncausestheneurodevelopmentaldisorderPrader-Willisyndrome(PWS)aclassicgenomicimprinting-associateddisorderGenomicimprintingisagenesilencingprocessthroughcytosine-specificmethylationatCpGsitesIanalyzedthemethylationstatusofCpG-richregionofmousendnusingbisulfiteconversionmethodbasedontheprinciplethatmethylatedcytosineisprotectedfromconversiontouracilThereforethedifferencebetweenmethylatedandunmethylatedcytosinecanbedetectedbyDNAsequenceanalysisGenomicDNAsampleswerepreparedfromneuralstemcells(NSCs)oftheneocortexofE145ndn-mutatedmiceThepaternalalleleofndn-mutatedmiceismutatedbyinsertionwithaneomycin-resistantgenecassetteUsingprimersthatspecificallyrecognizeNecdinandneomycin-resistantgenesequencesthedifferencebetweenpaternalandmaternalNecdinallelescanbedistinguishedAmongCpGislandsfrom-264to+470(ATGtranslationstartsite=+1)23CpGsitesfrom-229to+93inwhichthetranscriptionandtranslationstartsitesareincludedwereanalyzedWefoundthatDNAsequencedataindicatedthat60%and53%ofCpGsitesweremethylatedinundifferentiatedanddifferentiatedcorticalNSCsrespectivelyIncontrast62%and40%oftheCpGsitesinthepaternalalleleweremethylatedinundifferentiatedanddifferentiatedNSCsrespectivelyTheresultsalsoindicatedthatthemethylationstatusisregulatedinboththepaternalandmaternalallelesduringneuraldifferentiationofNSCsbutthemethylationstatusofthepaternalalleleismoreaffectedthanthatofthematernalalleleFurthermoresomespecificCpGsitesinthepaternalandmaternalallelesareprofoundlyaffectedbyneuronaldifferentiationTheseresultssuggestthatndnexpressionisregulatedthroughmethylationofspecificCpGsitesduringneuronaldifferentiation
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